Este es un problema común para todos los acondicionadores de aire (en un coche o no), y es causado por el crecimiento de moho. En los coches suele ocurrir cuando la gente hace funcionar su aire acondicionado en la recirculación todo el tiempo, o el desagüe se obstruye. El sistema no se seca completamente y el moho comienza a crecer.
Deberías preocuparte por tu salud, especialmente si tienes alergias. Imagina todo ese moho y Dios sabe qué más crece ahí y se te echa en la cara cada vez que enciendes el aire acondicionado… Aquí hay un enlace a la página de la EPA de EE.UU. que describe cómo el moho puede afectar a la salud, si todavía no estás convencido.
Las cosas que debes hacer para eliminar la causa de tu problema y evitar que vuelva a suceder:
Ponlo en recirculación sólo cuando algo apeste fuera, o quieres que se enfríe rápidamente. El aire fresco del exterior ayudará a que se seque mejor.
Asegúrate de que el desagüe del aire acondicionado no esté obstruido y no se acumule agua.
Y esto es lo que podrías hacer para eliminar los efectos desagradables:
Poner la calefacción a tope durante un tiempo, eso secará el sistema y podría “cocinar” el moho.
Cambie el filtro de aire de su cabina (si tiene uno).
Se venden aerosoles especiales para eliminar el moho del sistema de aire acondicionado (lea las instrucciones cuidadosamente antes de usarlos). Usar Lysol o alguna otra cosa así también funcionará, pero el olor será más desagradable.
Sugiero que haga todo esto, y en el orden especificado.